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What?“垃圾DNA”

閱讀次數(shù):909   發(fā)布時(shí)間:2019/1/25 11:25:01

為什么在您的科研中使用“假基因”的三個(gè)理由:
蛋白質(zhì)編碼DNA或“功能”基因在人類基因組中僅占2%。 至今,其余98%因共非編碼特征而被稱為“垃圾DNA”。 這個(gè)名字本身就意味著垃圾DNA是無用的,可以忽略。 然而,進(jìn)一步的研究表明,實(shí)際上垃圾DNA可能對(duì)我們的基因組的功能至關(guān)重要。 例如,有沒有想過為什么人星形膠質(zhì)細(xì)胞和肝細(xì)胞來源于同一受精卵,并且攜帶完全相同的遺傳信息,但它們的發(fā)育,形態(tài)和功能差別很大? 雖然部分原因在于表觀遺傳學(xué),其中基因表達(dá)受表觀遺傳修飾如DNA甲基化調(diào)控,但一些研究人員也在尋找所謂的“垃圾DNA”中的線索。 結(jié)果發(fā)現(xiàn)了“假基因”,并揭示了它們維持正常細(xì)胞生物學(xué)的多種作用。

顯然,“假基因”是與其相應(yīng)的功能基因具有高序列相似性的DNA片段,但已失去其部分或全部功能。與功能基因研究的相比,“假基因”研究還處于起步階段。 不過,您有理由認(rèn)真對(duì)待您的研究中的“假基因”。

 1. “假基因”的出現(xiàn)比想象中更常見、更重要

現(xiàn)在我們普遍認(rèn)為,在人類基因組中,“假基因”的數(shù)目至少與蛋白質(zhì)編碼的“功能基因”的數(shù)量相當(dāng)。許多基因,甚至是您的感興趣的基因,都有一個(gè)或多個(gè)相應(yīng)的“假基因”。 雖然仍然被認(rèn)為是垃圾DNA,但是很多“假基因”都得到轉(zhuǎn)錄,有些甚至被翻譯。證據(jù)表明,一些“假基因”的轉(zhuǎn)錄水平是至關(guān)重要的,“假基因”的失調(diào)可能誘發(fā)各種疾病和病癥的發(fā)病機(jī)制。

 2. “假基因”可能影響功能基因的表達(dá)。

如您所知,基因轉(zhuǎn)錄水平在正常細(xì)胞代謝的許多方面起決定性作用,并通過復(fù)雜的網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行嚴(yán)格調(diào)控。“假基因”也可以在這個(gè)調(diào)節(jié)中發(fā)揮作用。許多“假基因”由基因的重復(fù)事件產(chǎn)生,因此與相應(yīng)的功能基因序列有高度相似性。因此,當(dāng)“假基因”被轉(zhuǎn)錄時(shí),它們與功能基因相似的mRNA可以作為競(jìng)爭(zhēng)的內(nèi)源性RNA(ceRNA)來調(diào)節(jié)相應(yīng)功能基因的表達(dá)水平。

 3. 不能將“假基因”的轉(zhuǎn)錄水平與其相應(yīng)的功能基因區(qū)分開來,可能會(huì)造成研究數(shù)據(jù)的假象。

雖然序列高度相似,“假基因”和相應(yīng)的功能基因在細(xì)胞生物學(xué)中顯然起不同的作用,并通過不同的機(jī)制進(jìn)行調(diào)控。 分別分析是獲取正確結(jié)論的先決條件。 以其高度序列相似性,通過qPCR分開它們是不容易的。 必須仔細(xì)設(shè)計(jì)引物,以確保不僅PCR高效率,而且還可以確保“假基因”或功能基因的特異性。許多時(shí)候,兩者之間的差異只是幾個(gè)核苷酸,需要專業(yè)知識(shí)才能成功進(jìn)行qPCR分析。 區(qū)別較小的qPCR引物可能導(dǎo)致不可靠甚至錯(cuò)誤的結(jié)論。

ScienCell研究實(shí)驗(yàn)室開發(fā)了世界上個(gè)假基因轉(zhuǎn)錄分析qPCR試劑盒,以更好地幫助您分析假基因轉(zhuǎn)錄及其對(duì)功能基因表達(dá)的影響。我們的試劑盒保證每個(gè)引物組僅擴(kuò)增指定的基因或假基因而不進(jìn)行交叉擴(kuò)增。無論您是否已經(jīng)考慮到假基因,或者只是在今天學(xué)習(xí)假基因,我們都向您伸出援助之手。我們的科學(xué)家將幫助確定與您的研究相關(guān)的假基因和評(píng)估它們的*jia方式。

 

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